ボスは各島に配置された強敵NPCです。倒すことでお金・経験値・レアドロップが入手できます。ボスはリスポーン時間があり、倒した後しばらくで復活します。
First Sea ボス
| ボス名 | レベル | 場所 | 主なドロップ |
| Gorilla King | 22 | Jungle | お金・経験値 |
| Saw | 100 | Prisoner Island | お金・経験値 |
| Yeti | 110 | Snow Mountain | お金・経験値 |
| Bandit King | 35 | Middle Town | お金・経験値 |
| Bobby | 40 | Pirate Village | お金・経験値 |
| Swan | 225 | Marine Fortress | Swan Glasses(アクセサリー) |
| Arowe | 155 | Frozen Village | お金・経験値 |
| Fajita | 250 | Skylands | お金・経験値 |
| Jeremy | 425 | Upper Skylands | お金・経験値 |
| Diamond | 475 | Fountain City | Diamond(素材) |
| Vice Admiral | 700 | Marine Fortress(深部) | お金・経験値 |
| Warden | 325 | Impel Down | お金・経験値 |
| Chief Warden | 380 | Impel Down(深部) | お金・経験値 |
| Magma Admiral | 750 | Magma Village | お金・経験値 |
| Ice Admiral | 850 | Ice Castle | Bisento(稀) |
| Saber Expert | 200 | Saber Expert Island | Saber(剣) |
Second Sea ボス
| ボス名 | レベル | 場所 | 主なドロップ |
| Darkbeard | 1000 | Darkbeard Island | Darkbeard Fragment(素材) |
| Don Swan | 1500 | Colosseum | Swan Glasses(確定) |
| Ben Smoker | 1150 | Marine HQ | お金・経験値 |
| Awakened Ice Admiral | 1100 | Iceberg | お金・経験値 |
| Smoke Admiral | 1200 | Kingdom of Rose | お金・経験値 |
| Fajita(2nd) | 1475 | Green Zone | お金・経験値 |
| Jeremy(2nd) | 1350 | Underwater City | お金・経験値 |
| Guardian(Forgotten Island) | 1300 | Forgotten Island | お金・経験値 |
Third Sea ボス
| ボス名 | レベル | 場所 | 主なドロップ |
| Stone | 1700 | Port Town | Stone Fragment(素材) |
| Island Empress | 1875 | Floating Turtle | Dark Dagger(剣) |
| Kilo Admiral | 2000 | Tiki Outpost | お金・経験値 |
| Captain Elephant | 1975 | Floating Turtle | Pole(2nd Form)(剣) |
| Beautiful Pirate | 2075 | Hydra Island | お金・経験値 |
| Cake Queen | 2050 | Sea of Treats | Canvander(剣) |
| rip_indra | 2300 | Haunted Castle | Hallow Scythe(剣) |
| Soul Reaper | 2050 | Haunted Castle | Soul Guitar(武器) |
| Longma | 2500 | Dragon Nursery | Dragon Scale(素材) |
| Demonic King Buddha | 2400 | Cursed Ship | Trident(剣) |
レイドボス(Raid Bosses)
レイドボスはFragmentsを消費して召喚する特殊ボスです。倒すことでフルーツ覚醒に必要な素材が入手できます。
| レイドボス名 | 対応フルーツ | 召喚アイテム | 報酬 |
| Greybeard | Quake | Military Detective | Rumble Fragment |
| Darkbeard | Dark | Darkbeard's Crew | Dark Fragment |
| Order | Paw / Barrier | Mysterious Scientist | Paw Fragment |
| Cake Prince | Dough | Special Cake | Dough Fragment |
| Dough King | Dough(上位) | Sweet Chalice | Dough Fragment(大) |
| Tyrant of the Skies | Phoenix | Fire Feather | Phoenix Fragment |
| Unbound Werewolf | Shadow | Bloody Moon | Shadow Fragment |
💡 レイドボスは第2・第3の海でのみ召喚可能です。召喚にはFragmentsと素材が必要で、協力プレイが推奨されます。